Le microbiote intestinal

Microbiote ou microbiome, quelle différence ?

Le microbiote et le microbiome constituent deux notions distinctes fréquemment confondues. Le microbiote désigne l'ensemble des micro-organismes habitant un environnement précis, notamment le tube digestif humain, tandis que le microbiome englobe l'ensemble du patrimoine génétique de ces organismes microscopiques.

Le corps humain accueille plusieurs microbiotes différents, chacun possédant une composition bactérienne singulière. Ces microbiotes se situent dans la bouche, la gorge, le nez, la peau, le vagin et l'intégralité du tube digestif.

Le microbiote intestinal, notre deuxième cerveau

Anciennement appelé flore intestinale, le microbiote intestinal représente l'ensemble des micro-organismes — bactéries, virus, parasites, champignons non pathogènes, dits commensaux — qui vivent au sein de notre organisme sans lui causer de préjudice. C'est le plus important de tous nos microbiotes, avec 100 000 milliards de micro-organismes, un nombre équivalent à celui des cellules qui constituent notre corps.

Le microbiote intervient dans les fonctions digestives, métaboliques, immunitaires et neurologiques. S'il est déséquilibré, il devient propice aux pathologies, en particulier les maladies auto-immunes et inflammatoires.

Qu'est-ce qui détruit la flore intestinale ?

Les micro-organismes vivants du microbiote intestinal peuvent malheureusement être détruits sous l'influence de différents facteurs. Une alimentation déséquilibrée, la consommation de tabac ou d'alcool, la pollution constituent autant d'éléments susceptibles de perturber l'équilibre de la flore digestive — on parle alors de dysbiose.

Les symptômes d'un microbiote déséquilibré

Un déséquilibre du microbiote se manifeste dans la plupart des cas par des troubles digestifs : ballonnements, flatulences, gaz, transit perturbé, douleurs abdominales. Ces signes peuvent être ressentis après un repas, indépendamment des repas, ou de manière ciblée lors de la consommation d'aliments particuliers.

Dans certains cas, la dysbiose peut également être associée à d'autres troubles : asthme, éruptions cutanées et acné, intolérances alimentaires, mauvaise haleine (halitose), douleurs prémenstruelles, cystites (surtout chez la femme), infertilité (surtout chez l'homme), fatigue, anxiété voire dépression, maux de tête…

Trois pathologies digestives fréquentes lors d'une dysbiose

L'intestin poreux, ou « leaky gut »

La porosité intestinale, aussi appelée syndrome de l'intestin qui fuit, concerne une fragilité de la muqueuse intestinale qui ne joue plus son rôle de protection ou de barrière, laissant ainsi passer des corps étrangers non souhaités pour le bien-être et le bon fonctionnement de notre organisme. Une muqueuse intestinale saine se compose de cellules, appelées entérocytes, collées hermétiquement les unes aux autres. Cette porosité met en alerte notre système immunitaire et devient ainsi le siège de maladies inflammatoires.

Pour aider à réparer ses intestins naturellement, on peut consommer du thé vert et/ou du thé rooibos, des céréales complètes ou semi-complètes (quinoa, riz, millet, sarrasin), ainsi que des aliments qui aident à réparer la muqueuse tels que les huiles riches en acides gras essentiels (olive, colza, noix, chanvre).

Les aliments fermentés, alliés du microbiote

Les lacto-fermentations constituent des aliments prébiotiques, c'est-à-dire bons pour les micro-organismes du système digestif. Riches en fibres et très digestes, les légumes fermentés nourrissent une fois dans notre corps les bonnes bactéries qui vivent en nous. Les ferments lactiques ne sont pas tués par la pasteurisation et permettent aux aliments de développer des qualités nutritionnelles, notamment anti-oxydantes.

• Ils facilitent la digestion — riches en enzymes digestives, ils « prédigèrent » l'aliment. On peut ainsi consommer du chou (transformé en choucroute) sans être ballonné, ou du lait fermenté sans souffrir de son lactose.
• Ils renforcent le système immunitaire — en gardant intactes vitamines et minéraux et en facilitant l'absorption par l'intestin, ils augmentent les défenses immunitaires.
• Ils favorisent un bon microbiote intestinal, scientifiquement reconnu comme notre deuxième cerveau, dont l'altération est à l'origine de nombreuses pathologies.

7 aliments fermentés à privilégier

Sous réserve d'intolérances aux levures ou aux FODMAPs, il est préférable de consommer les légumes fermentés crus plutôt que cuits — l'idéal étant une à deux cuillères à soupe en début de repas.

Prendre soin de son microbiote au quotidien

Pour retrouver un microbiote sain (eubiose), certains antibiotiques naturels peuvent être envisagés — ail, armoise, berbérine, extrait de pépins de pamplemousse, huile d'origan — en complément d'une alimentation adaptée. Enfin, pratiquer un sport, dormir 7 à 9 heures par nuit, éviter le stress, s'aérer, se détendre et rire restent des piliers essentiels d'un microbiote équilibré.